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新疆农业大学科学技术学院成立于2002年7月，是经国家教育部批准为实施普通高等学校本科全日制教育的独立学院。
学院位于乌鲁木齐市南昌路42号附1号。学校占地380亩，校舍面积47301㎡，环境优雅，条件齐备。科技学院独立校区建设规划正在逐步落实。学院采用新型管理体制和运行机制，构建“学院自主、社会参与、市场介入、政府调控”的良性互动外部发展环境，实行独立法人、独立财务核算、独立教学管理的新体制。新疆农业大学负责承担学院的教学和管理工作，负责为其提供师资，并对科技学院实施相对独立的教学组织管理。学院实行全员聘任制和岗位负责制，根据精干高效的原则，按需设岗，注重实际绩能。现聘任专职教师171人，其中教授25人，副教授63人；在职管理人员14人，其中正高职称4人，副高职称7人。
科技学院目前设有经济学、国际经济与贸易、英语（科技英语）、电子信息科学与技术、水利水电工程、人力资源管理、食品科学与工程等24个本科专业（方向），有各类学生1080人，其中本科生969人。
学生毕业后授予国家统一印制的新疆农业大学科学技术学院毕业证书，并经新疆农业大学学位委员会审核，授予新疆农业大学学位证书。
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